Paris'in ünlü Place Pigalle bölgesinde, gizemli bir kadın olan Emmanuelle, sıradışı bir klinik işletmektedir. Ancak bu klinik, sıradan kadın hastalıklarını tedavi etmekten çok daha fazlasını sunmaktadır. Emmanuelle, aslında bir kadın doktoru olarak değil, gizli ve çekici bir şekilde "Kadınlar Doktoru" olarak tanınmaktadır.
Emmanuelle, sadece kadınların cinsel sağlığını değil, aynı zamanda onların gizli arzularını ve fantazilerini de tedavi etmektedir. Kliniğinde, kadınlar özgürce cinselliği keşfederken, kendi iç dünyalarında derinlere inme fırsatı bulurlar. Emmanuelle, her bir kadını kişisel yolculuklarında yönlendirirken, onlara cinsel özgürlüğün ve kabulün önemini öğretir.
Ancak bir gün, Emmanuelle'ın klinik işlerinin arkasındaki gerçek sırlar ortaya çıkmaya başlar. Emmanuelle'ın gizemli geçmişi ve klinikte yürüttüğü sıradışı uygulamalar, yerel yetkililerin dikkatini çeker. Klinik, kapatılma tehlikesiyle karşı karşıya kalırken, Emmanuelle, hem kariyerini hem de hayatının aşkını korumak için mücadele etmek zorunda kalır.
